Il capitano Malcom Reynolds è un veterano della guerra civile che ha sconvolto la galassia ed ora si guadagna da vivere a bordo della sua navicella, Serenity. Mal è il capo di un piccolo, eclettico equipggio e quando accetta di trasportare un giovane medico e sua sorella, una ragazza telepatica, non sa di aver accolto a bordo molto più di due semplici passeggieri. I due infatti, fuggono dall'Alleanza, la coalizione che domina la galassia. Serenity si trova così improvvisamente intrappolata tra una forza militare inarrestabili, la furia cannibali dei Reavers, ed una minaccia nascosta nel cuore della stessa navicella...