Alla nascita di un nuovo e potente Digimon Internet, che comincia a distruggere dati ad una velocità preoccupante, devono intervenire i Digidestinati. Si tratta di bambini scelti per salvare il mondo digitale prima che i danni siano irreversibili e le comunicazioni mondiali vengano interrotte per sempre. Quando vengono lanciati dei missili controllati dal computer ed un Digimon ribelle rapisce i Digidestinati, solo gli sforzi coingiunti di un gruppo internazionale di bambini e dei nuovi "Digidestinati" riusciranno a salvare i loro predecessori e fermare un disastro di portata mondiale.
